Profil lulusan prodi S1 MP FIP UNY adalah “pengelola lembaga pendidikan yang bertakwa, profesional, berbudaya Indonesia dan berdaya saing global”. Profil lulusan tersebut dicapai dengan penguasaan kompetensi mengelola satuan pendidikan  (persekolahan)/unit penyelenggara pendidikan (yayasan, dinas pendidikan, lembaga diklat, atau lainnya) dan kompetensi mengembangkan praksis manajemen pendidikan. Kompetensi tersebut dibentuk dari penguasaan elemen-elemen pengetahuan, keterampilan, dan sikap profesional dalam melaksanakan kepemimpinan pendidikan; supervisi pendidikan; pengelolaan peserta didik, sumber daya manusia pendidikan, keuangan pendidikan, sarana dan prasarana pendidikan, hubungan lembaga pendidikan-masyarakat, ketatalaksanaan pendidikan dan sistem informasi pendidikan.